华为云深度赋能基因行业助力基因测序快速发展

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近年来,基因测序技术在基础研究和临床应用等领域都得到了广泛的应用,随着技术的不断发展和测序市场的不断规范化,中国基因测序市场增速明显,进入快速发展期,已成为全球NGS(next-generation sequencing)市场的大本营之一。2007-2017年,中国基因测序行业市场规模增速高于全球整体水平,年均复合增速高达47.5%;2017年市场规模突破了70亿元。据中商产业研究院推测,2022年这一数字将突破150亿元。随着应用于基因测序的技术日渐成熟,未来十年将是基因组商业模式成熟的“黄金十年”。

随着大数据与生命科学的不断融合,生命科学产业正在发生剧变,“精准医疗”变为现实,基因测序产生的海量数据的处理成为新的挑战,逐步上云成为数字生命时代势在必行的举措。

梳理近期券商观点看,对于建筑、水泥等传统周期品种,由于低估值叠加政策预期,市场看好其阶段性机会。相比之下,对5G建设及应用方向更受到大部分券商青睐。

当前,基因测序的工作重心已经从序列读取转向数据处理,基因数据分析和解读是关系到基因测序发展和精准医疗应用的关键环节。但是,目前基因测序的数据分析也存在很多难点,例如:算力无法弹性匹配、主机运行效率难以提升、海量数据存储共享实现困难等,在一定程度上阻碍了临床应用的发展。

2018年,华为云推出了全球首家基因容器服务GCS(GeneContainer Service),基因容器服务是业界首个基于Kubernetes平台,结合Docker容器技术打造的基因测序云服务,基于轻量级的容器技术,结合大数据、深度学习算法,为测序厂商提供了灵活可定制的测序流程、秒级可伸缩的高可靠资源和便捷一站式用户体验,让基因测序数据的计算更省、更快、更轻松。华大基因使用华为云技术后运行周期大大减少。

云技术在基因测序行业中扮演怎样的角色?

3月2日两市行业板块普涨,在申万一级行业中,建筑材料、建筑装饰、通信位居涨幅榜前三位,此外,机械设备、钢铁、房地产等板块涨幅也较显著。

华为云基因测序解决方案架构/来源:华为云官网

回顾历史,2000年以来美股曾多次出现较大幅度下跌,造成下跌的原因往往与基本面变化、突发性事件、经济数据以及政策类因素相关。据粤开证券统计,2000年至今,日经225、韩国综合指数、富时100与道指的相关系数分别为0.85、0.75、0.84,近几年来相关度进一步提升,2017年以来的相关系数更是均在0.95以上,与美股的相关性更高;而A股与美股的相关性较低,短期内可能随美股出现下调,但中长期走势仍将回归基本面。

戴康认为,近几年通信网络的建设速度也远高于传统基建的增速。基建本身的目的一是改善当地居民生活质量,二是给予发展赋能。未来的基建加码,不仅是传统基建的进一步拓展,且将包含更多高质量发展的部分,以带动有效产业投资,不仅带来经济增量,也同时契合经济转型升级。新型基建的占比将进一步提升,同时传统基建的智能化改造也将同步进行。

当日盘面中的强势品种主要围绕老基建和新基建方向,从个股方面看,涨停个股也大多集中在这两个方向。

华大基因科技服务测序过很多复杂基因组,单一规格的计算资源无法满足业务需求,云计算提供的可供灵活选择的计算资源是最好的选择。

线下集群架构不支持高通量的计算(多任务并行),超算测试过之后也无法解决高通量计算问题(主要问题是测序软件针对云计算的优化)。面对这个问题,华为云利用基因容器技术,对客户常用的软件进行了优化,为华大基因提供了云端基因测序解决方案,支持DNA、RNA、液态活检等主流生物基因测序场景。

在基因检测领域,对于采集的基因样本进行数据分析和处理需要大量的计算资源。基因测序公司需要庞大的算力支持;生命科学的研究竞赛,很多时候已经变成了一场算力的比拼,大的科研成果通常是基于庞大的数据。现在的产前检测、肿瘤检测等医疗检测也会消耗大量的算力。以上这些基因测序对算力的需求都是波动的,往往Q4的消耗最大而Q1最少,同时对于不同生物的基因组,需要的算力也不同,这就会牵扯到计算集群的扩缩容,传统的线下计算集群是做不到快速的扩缩容的,这就是使用云计算的便利性。

云计算正是解决基因检测行业痛点的强大工具,随着5G时代的来临,云计算将在保障海量数据的计算、存储和分析的同时,带给基因测序行业更多可能。

针对基因测序行业,华为云专门为客户定制了多种高度整合的基因测序解决方案。相对行业中传统使用的HPC高性能计算集群,基因容器服务有着明显的领先优势:资源调度更灵活,计算可以按需伸缩,任务流程方便自定义,容器更易维护升级等。

一些机构还认为,A股上涨逻辑并未改变。在国信证券看来,A股上涨的逻辑主要有两个:科技板块盈利周期向上和流动性政策宽松。从科技板块盈利的角度看,大体从2019年三季度开始,中小创公司的盈利周期上行拐点出现,创业板公司当季净资产收益率(ROE)出现向上迹象。并且从目前已经公布2019年年报业绩预告的情况来看,创业板公司业绩增速明显上升。从流动性的角度看,“稳中求进”是当前主要的政策基调,稳增长要求货币政策将是易松难紧。

中信证券表示,3月市场将进入四期叠加的环境,市场依然处于“小康牛”的途中,预计3月将进入平和期,是全年绝佳的配置时机。首先是全球资本市场已出现较充分调整,美股巨震不会进一步诱发全球系统性风险。其次是国内经济进入快速恢复期,政策层加码,复工复产开始加速爬坡,预计4月将基本接近正常水平。

基因数据量规模不断扩大,大量数据分散在不同的国家、城市、医院,缺乏统一性。这样分散、游离状态的数据不利于大数据指导下的精准医疗研究。数据统合和共享是阻碍基因测序数据临床转化的一个难点。

3月2日A股三大股指迎来强力反弹。之前几个交易日的走势,仍受到外围股市的影响。

平安证券表示,科技新基建是政策重要发力点。在传统铁公基投资增长边际弱化的背景下,今年基建投资将主要集中在科技新基建和补短板领域。一是信息网络建设等新型基建;二是以生态环保、城市改造、医疗设施等为代表的市政民生补短板领域;三是以城际轨道交通、机场、冷链物流等为代表的交通物流网络建设。

兴业证券表示,阶段性关注配置“两头走”的低估值、高分红、增长稳的核心资产价值龙头。全年依然看好大创新科技成长。在一系列稳政策措施促进下,核心资产价值龙头公司经历调整后,估值在底部区域、业绩稳定增长,相对性价比凸显,阶段性配置价值值得重视。从全年来看,大创新科技成长机会仍值得重视。以产业视角去理解由5G带来的产业互联网变革,由特斯拉带来新能源车的汽车产业链变革。

对于基因测序行业来说,有着最好的发展机遇,但也面临着巨大的挑战,这个挑战就是如何做到测序更快、分析更快,更重要的是技术创新更快,通过结合云技术、人工智能、5G等新技术将为行业带来了全新动力。只有这样,企业才能在竞争中脱颖而出,整个行业也才能适应精准医疗的发展速度,以科技造福未来。

“在2020年已发行的政府专项债使用中,投向新基建的比例有所上升。”广发证券策略分析师戴康表示,过去的基建集中于通水通路通电,而“通网”则作为新基建逐步在各地展开。

以华大基因与华为云的合作为例,双方发挥各自优势,华大基因的核心业务系统迁移上云,堪称是云计算在行业内应用落地、技术真正服务于社会的典范。

现阶段,基因测序的应用还是主要集中在无创产前检测和肿瘤诊断治疗两个领域,在临床方面并未广泛应用,随着应用的更加广泛,对密集计算和海量数据处理能力也有更高的要求。

目前的数据缺乏标准化,在很多情况下,即便是同一家医院,由于生物测序设备、软件甚至流程不同,数据形式都会大相径庭。“当我们把这种数据放在一起,会出现系统性的偏差。”业内从业者表示,“标准化所指的不仅是分子数据,也包括患者的个体信息、用药和愈后随访。这些数据信息的统一和一定程度的共享,需要得到解决。”

云计算助力基因测序快速发展和技术创新

把脉基因行业痛点,算力才是关键

华为云携手华大基因助力行业发展

天风证券表示,3月关注三条主线:首先是一季报业绩,重点看好游戏等在线板块;其次是新基建,重点看好5G及信息化应用;最后是逆周期发力,重点看好地产、水泥。

万联证券表示,基于中国经济的发展韧性,行业配置建议关注未来业绩增长较确定的消费、基建产业链、地产产业链等。这些板块估值处于低位,今年经济要保持稳增长,后续投资和消费是稳增长的重要抓手,随着开工项目的增加,中期角度看这些板块是布局的较好时机。对于消费板块,由于消费的韧性较强,从两年的时间维度看,当前具有较好的布局意义。同时,对于补短板重要领域的科技股和医药股,核心公司属于长期发展的主线,在大幅调整后仍然具有配置意义,关注5G产业链、消费电子、新能源车、半导体、国产替代等科技产业。

粤开证券表示,考虑到基本面、政策面以及估值情况,中长期来看,A股受外围市场影响相对较小。事件性因素对A股的影响逐渐下滑,后续逆周期政策有望进一步发力,A股现阶段仍然具有较强的投资价值。

通过华为云与华大基因的合作案例,我们可以清晰的看出,华为云可以减少运行周期,提高计算效率和数据储存能力,缩短报告周期,保障海量数据的计算、存储和分析等,带给基因测序行业更多可能,为基因测序行业插上新的翅膀,将算力发挥到极致,可以更快、更多的进行生物信息分析,拓展应用领域,助力精准医疗更快的发展。